Das Kapsid von adeno-assozierten Viren (AAVs) besteht aus drei viralen Proteinen (VP, 62-90 kDa). Veränderungen in der Proteinzusammensetzung können die Wirksamkeit des Vektors beeinflussen und das Risiko für Immunogenität erhöhen.

Um das Verhältnis der drei Proteine VP1, VP2 und VP3 verlässlich zu bestimmen, eignet sich Umkehrphasen-Flüssigchromatographie gekoppelt an Massenspektrometrie (MS). Nur in Kombination mit bioinerter Säulen-Hardware kann eine sehr gute Trennung der drei Proteine erzielt werden. Bei konventioneller Edelstahl-Hardware interagiert die negativ geladene Kapsid-Oberfläche mit dem Säulenkörper, was zu einer verringerten Auflösung führt.

Der Vorteil der bioinerten YMC-Accura Triart Bio C4 Säule bei der Analyse von AAV-Kapsid-Proteinen: scharfe und hervorragend getrennte Peaks.

Diese Technical Note demonstriert die Vorteile der bioinerten YMC-Accura Triart Bio C4 Säule bei der Analyse von AAV-Kapsid-Proteinen.

Für mehr Informationen über YMC-Accura Triart Säulen, besuchen Sie diese Seite hier oder laden Sie den YMC-Accura Triart Flyer herunter.

Für die Analyse von Oligonukleotiden wird vorwiegend IP-RP verwendet. Aufgrund der stark polaren Natur von Oligonukleotiden kann HILIC ein alternativer Ansatz sein. Dieser Expert Tip vergleicht die Analyse von Oligonukleotiden unter Verwendung beider Methoden. Außerdem wird gezeigt unter welchen Bedingungen die Methoden präferiert werden.

In beiden Modi wurden die untersuchten poly(dT)-DNAs nach Länge getrennt, beginnend mit der kürzesten. Darüber hinaus zeigen DNA und RNA mit der gleichen Sequenz eine ähnliche Retention im HILIC-Modus, während die DNA im IP-RP-Modus eine stärkere Retention zeigt. Verschiedene chemische RNA-Modifikationen, vollständig phosphorothioiert und vollständig methoxyliert, zeigten ein unterschiedliches Trennungsverhalten in HILIC und IP-RP.